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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

“欧中应进一步扩大共识与合作”******

　　德国联邦经济发展与对外贸易协会主席米夏埃尔·舒曼日前接受本报记者专访时表示，国际社会应团结起来，共同应对全球性挑战。中国在二十国集团巴厘岛峰会上提出，要推动更加包容、更加普惠、更有韧性的全球发展，强调推进贸易和投资自由化便利化，推动建设开放型世界经济，“这些倡议具有建设性，值得各方借鉴”。

　　“为了推动世界经济复苏，各方应共同努力，消除贸易壁垒，加强基础设施投资，改善互联互通。”舒曼认为，必须进一步加强国际合作，支持对联合国进行改革。各方应保持对话，反对将世界经济政治化、工具化、武器化，避免国际组织和机构被个别国家左右。“加强与中国的合作，推动全球治理体系变革，推动包容普惠发展，符合德国和欧洲的利益。”

　　“主权国家根据自己的主权行事，不受任何其他权威的命令强制，也不容许外来干涉。个别西方国家处理国际事务的做法违背了国际关系基本准则和世界多极化趋势。”舒曼指出，多边主义是现有国际秩序的基石。各国必须奉行和平共处原则，尊重各国自主选择的发展道路。当前，亚洲国家经济迅速发展，国际影响力显著提高，希望更多地参与全球治理体系改革和建设。他表示，西方国家必须承认并接受这一现实，认真倾听亚洲国家的声音，与亚洲国家共同为促进世界和平发展发挥建设性作用。

　　“中国致力于维护全人类共同利益，中方提出的全球发展倡议值得肯定。”舒曼认为，国际贸易、数字经济、绿色转型、反腐败等领域的国际合作对促进全球发展至关重要。近年来，中国在数字化转型和可持续发展方面取得了重要成就，经验值得各方借鉴。

　　舒曼表示，长期以来，德中两国都坚定维护多边主义。中共二十大召开后，朔尔茨总理对中国进行正式访问，同中方一道向世界发出坚持多边主义、维护自由贸易的积极信号。“国际社会必须团结一致，坚决反对阵营对抗。”舒曼说，德中、欧中在共同应对全球性挑战方面拥有巨大合作潜力，“为了我们共同的利益，欧中应进一步扩大共识与合作”。

　　（本报柏林电 本报记者 花放）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）